Menjadi Fakultas Kedokteran dan Ilmu Kesehatan yang unggul dan bereputasi internasional melalui integrasi sains dan Islam untuk mewujudkan masyarakat yang maslahat.

1. Menyelenggarakan pendidikan tinggi Islam yang berkualitas, integratif, dan adaptif untuk menghasilkan tenaga kesehatan ulul albab dengan keunggulan kesehatan haji dan produk halal.
2. Menyelenggarakan penelitian integratif di bidang kedokteran dan kesehatan dengan keunggulan kesehatan haji dan produk halal.
3. Menyelenggarakan pengabdian kepada masyarakat integratif di bidang kedokteran dan kesehatan dengan keunggulan kesehatan haji dan produk halal.
4. Menyelenggarakan tridarma perguruan tinggi berbasis konvergensi.
5. Menyelenggarakan good faculty governance.
6. Menyelenggarakan smart and green Islamic faculty.
7. Meningkatkan rekognisi dan reputasi internasional.

Masing-masing misi memiliki tujuan yang merupakan panduan arah implementasi visi- misi, yaitu:

1. Menghasilkan tenaga kesehatan ulul albab dengan keunggulan kesehatan haji dan produk halal;
2. Menghasilkan karya dan produk inovatif dari penelitian integratif di bidang kedokteran dan kesehatan dengan keunggulan kesehatan haji dan produk halal;
3. Menghasilkan program dan kegiatan pengabdian kepada masyarakat yang integratif dan berkelanjutan di bidang kedokteran dan kesehatan dengan keunggulan kesehatan haji dan produk halal.
4. Mewujudkan kualitas pendidikan tinggi melalui penyelenggaraan tridarma perguruan tinggi yang konvergen
5. Mewujudkan tata kelola fakultas yang baik, transparan, akuntabel, dan berorientasi pada peningkatan mutu berkelanjutan.
6. Mewujudkan lingkungan fakultas yang cerdas, hijau, dan islami melalui penerapan prinsip efisiensi energi, ramah lingkungan, dan nilai-nilai keislaman dalam setiap aktivitas akademik.
7. Meningkatkan pengakuan, jejaring, dan reputasi internasional fakultas melalui kolaborasi tridarma, publikasi, kepakaran dosen, prestasi dosen, mahasiswa dan akreditasi internasional.